בגן הקסום ישנה תוכנית לימודית מובנית, שמטרתה להעשיר את הילדים. להלן מספר תכנים חשובים שעליהם אנו שמים דגש בגן:
חגים
תוכנית הלימודים מבוססת על דרישות משרד החינוך, וכוללת שירים, למידה ויצירה שמטמיעים את המונחים השונים הקשורים בחגים בצורה חווייתית ומהנה. בגן מעבירים את רוח היהדות, דרך קבלת שבת בימי שישי ותפילה מדי בוקר.
חוג חיות
מפעילת החוג מביאה חיות שונות, שאותן יכולים הילדים ללטף. בנוסף, הם לומדים על החיות, וחווים את הנוכחות שלהן. כל שבוע יש חיה אחרת.
חוג ריתמיקה
חוג של מוזיקה ותנועה, שמועבר בצורה חווייתית, המותאמת לילדים.